اين بخش شامل بررسی ماكروسكوپي ومیکروسکوپی و همچنین آزمایش خون مخفی Occult Blood (OB) روي نمونه هاي مدفوع می باشد.
آزمايشات ماكروسكوپي شامل مشاهده قوام ٬ رنگ مدفوع ، بررسي موكوس و غذاي هضم نشده می باشد. همچنین بایدکل نمونه داخل ظرف از نظر نماتود و كرم بررسی شود. نمونه های مدفوع به صورت 1 نوبته ، 2 نوبته و3 نوبته مي باشد .
در بررسي ميكروسكوپي لام مستقيم و همچنين لام تهیه شده از روش هاي تغليظ بررسی مي شود.
تك یاخته ٬ ترفوزوئيت٬ تخم ، کیست ، گلبولهای سفید ،گلبولهای قرمز، موكوس ، غذاي هضم نشده مورد بررسی قرار می گیرد حائز اهميت مي باشد .